（1）珍珠的内部结构：珍珠是由一系列的同心圆状珍珠质层组成，具有明显的圈层结构，中心往往存在一个珠核，天然珍珠的珠核一般为沙粒或小虫；养殖珍珠的珠核一般为较大的颗粒的圆形珠核和无核养殖的空洞。珍珠层包括三个部分：无定形基质层、方解石结晶层（又称棱柱层）、文石晶层（又称珍珠质层）。而无核的淡水珍珠一般只有珍珠层部分。
（2）珍珠表面形貌特征：珍珠表面形貌主要由贝、蚌等母体的生理状态、分泌物性质、年龄、生态环境和水中营养成分等因素所决定的。在理想状态下，珍珠表面光滑干净，而实际上珍珠表面经常出现许多瑕疵（如沟纹、瘤刺、斑点等）。在显微镜下，可看到珍珠表面由各薄层堆积所留下的各种形态花纹，有平行线状、平行圈层状、不规则条纹、漩涡状、花边状，类似于地图上的等高线，也有完全光滑无纹的，在电子显微镜下可清晰的看到台阶状的碳酸钙结晶层，每层都由六万板状的结晶体和胶态物质平行连结而成，其间有许多小空隙。
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